学校地处东莞市南城区水濂山麓，群山环抱，绿意盎然，是绝佳的办学宝地。学校占地133334平方米，其中绿化占地50150平方米，总建筑面积118323平方米。
与其它民办学校特别是名校异地合作办学的最大不同是：经营与投资的完全分离。南开附中不仅仅是输出品牌，更主要是通过全面直接负责学校的经营管理，最大限度引进和利用南开教育的优质资源。南开附中派出校长和多名各科骨干教师到东莞实验学校工作；投资方不介入学校的教学和管理，但在投资建校和办学财力需要上给予最大的支持和保证。

2办学理念

学校自创办以来，始终坚持高起点、高标准办学，以“传扬百年南开文明”为办学目标，以“做厚德的中国人”为培养目标，以“朴素简洁，传承创新，育才报国”为核心办学理念，构建“追求教育科学与民主”的管理思想，激励教师“用理性和激情实现教育理想”，坚持“气质培养，智慧教育，个性教育”的办学特色，确立“走优质高端道路，铸特色精品学校”为战略思想，简言之，就是“立足名城东莞，传承百年南开，以人的发展为本，创办特色精品学校”。